Eigentlich wollte sich MacGyver nach seinem anstrengenden Einsatz in Kolumbien, bei dem er einen jungen Journalisten aus den Händen des Drogenkartells befreit hat, ein paar Tage ausruhen. Wider besseres Wissen lässt er sich dann aber doch von seiner Schulfreundin Zoe Ryan, die jetzt als Archäologie-Professorin arbeitet, überreden, mit Hilfe eines wertvollen Artefakts namens "Die heilige Rose" ein historisches Rätsel zu lösen. Das Artefakt wurde von einem Alchemisten im 12. Jahrhundert geschaffen und ist der Legende nach einer von drei Gegenständen, die den Weg weisen zum Heiligen Gral. Das zweite Artefakt befindet sich im sagenhaften Tempel des Ambrosius, der sich als 800 Jahre alte Abtei in London entpuppt. Dort sind Zoe und MacGyver zwar erfolgreich und finden den zweiten Gegenstand. Doch sie müssen auch feststellen, dass sie in dem Edelsteinmagnaten Erich von Leer einen skrupellosen Gegenspieler haben, der Zoe kidnappt und MacGyver gefesselt unter einem pendelnden Fallbeil zurücklässt, das sich von Minute zu Minute tiefer senkt...